まず5リットルの容器をいっぱいにして、それを3リットルの容器がいっぱいになるまで入れるよ。
そしたら3リットルの容器の中身を全部捨てて、5リットルの容器に残った水（2リットル）を3リットルの容器に移すの。
この時点で3リットルの容器には水が2リットル入ってるね。
もう一度5リットルの容器いっぱいに水を入れて、また同じように3リットルの容器に入れていくと、もともと3リットルの容器には2リットルの水が入っていたから1リットルしか入らないね。
結果、5リットルの容器の中には4リットルの水が残るんだよ。
式にするとこんなかんじだね。

5-3=2（満タンの5リットルの容器から空の3リットルの容器に水を移す）
↓
0+2=2（一度中身を全部捨てた3リットルの容器に5リットルの容器に残っている水2リットルを移す）
↓
5-1=4（3リットルの容器にはあと1リットルしか入らないので5リットルの容器には4リットル残る）